故事发生在风景秀丽的密西西比河畔，汤姆（Tommy Kelly 饰）自幼丧母，是一个身世可怜的孤儿。然而，在朋友和亲戚们的帮助和扶持下，汤姆还是成长为了一个快乐勇敢的男孩。哈克贝利（Jackie Moran 饰）是汤姆最好的朋友，两个孩子在一起，常常惹出各种各样的麻烦，闹了数不清的笑话。一次偶然中，汤姆竟然成为了一宗凶杀案的目击证人，由于害怕遭到凶手的报复，汤姆和哈克贝利决定离家出走，踏上逃亡的旅途。汤姆的失踪让亲人倍感焦急，可他却在孤岛上开辟了自己的小天地，过得逍遥快活。最终，在案件即将审判之时，汤姆站了出来说出了真相，帮助法官做出了公正的判决。
马丁（Michael J. Fox 饰）才回到现实世界与女友团聚，布朗博士（Christopher Lloyd 饰）就心急火燎地把他们带到了30年后的未来世界，原来这一次是马丁未来的两个孩子因参与抢劫锒铛入狱，博士要携马丁一起阻止悲剧发生。 周旋一番后，两个孩子被成功挽救，但三人回到现实世界后，却发现周遭发生了天翻地覆的变化，世界被贝夫（Thomas F. Wilson饰）所控制，马丁的父亲乔治惨死，母亲洛莲（Lea Thompson 饰）竟然成了贝夫的妻子！ 这一切都是因为时光机器的秘密不慎被未来的
